候选基因如何分析？ 通常情况下关联分析会得到一大堆候选基因，总不可能每个都有用，因此需要对候选基因进行深一步分析，本篇笔记分享一下群体遗传学研究中GWAS候选位点与候选基因的筛选思路。主要的方式包括单基因关联分析、连锁程度分析、功能注释筛选、选择性消除分析等。 群体遗传学研究中，关联分析是一种常见的
GWAS结果文件分析与处理方法 引言 在使用GAPIT进行GWAS分析后，会自动在工作目录下生成若干结果文件，其中相对比较重要的是result.csv文件，该文件中展示了得到的显著位点详细信息，比如染色体、物理位置、p值等，接下来介绍一种算法，对其进行整理计算为绘图所需格式。 主要步骤与思路 读取数
Linux安装单细胞分析软件copykat 测试环境 Linux centos 7 R 4.1.2 minconda3 天意云24C192GB 安装步骤 新建环境 conda activate copykat
conda install r-base=4.1.2
安装基础软件 checkPkg <
算法：hmp文件转化与表型匹配 引言 分析过程中，如果已经得到了hmp文件，下一步是将表型数据与hmp中的基因型数据一一对应，保证两者的样品ID信息一致，还需要对数据的格式进行规范化处理，用于后续的GWAS分析。 本文提供一种算法，能够实现对hmp文件和表型数据的关联筛选与校正。 主要步骤与设计思路