文献精读笔记 英文题目：Systematic mining and genetic characteriza；tion of regulatory factors for wheat spike development 中文题目：小麦穗发育调控因子的系统挖掘及遗传特性研究 通讯作者：Jun Xiao
最近在学习一篇群体转录组和eQTLs相关的文献，做一个简单的笔记。该论文分析了287份材料的转录组数据，并在一个远端eQTL调控热点中鉴定到一个关键转录因子，它能够激活下游抗毒素合成相关基因的表达，从而影响水稻抗毒素的代谢水平和抗病性。文章篇幅比较长，可能会分成好几期。 " eQTLs play c
算法：vcf转txt并自动规范化 引言 vcf文件是存放基因变异信息的一种方式，本文提供一种算法，用于读取vcf文件并转换等位基因展示方法、替换染色体展示格式、以及自动识别非唯一变异并进行修改，用于对变异信息进行整理。 主要步骤与设计思路 读取VCF文件并分为三部分储存 提取变异信息并批量替换 修改
本文学习绘制简单小提琴图，包括介绍和绘图两部分，主要用到ggplot2包的geom_violin函数。 小提琴图是一种展示数据分布情况和数据统计信息的重要工具，能够看出数据的最大值、最小值、中位数、四分位数、分布密度、离群值等信息，它和箱线图比较类似。小提琴图怎么看？ 从上往下看，依次为： 离群点：